Protein–RNA interactions for Protein: A8MPX8

PP2D1, Protein phosphatase 2C-like domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PP2D1A8MPX8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PP2D1A8MPX8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PP2D1A8MPX8 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms