Protein–RNA interactions for Protein: A6NFU0

FAM187A, Ig-like V-type domain-containing protein FAM187A, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187AA6NFU0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FAM187AA6NFU0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
FAM187AA6NFU0 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms