Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GOLGA6CA6NDK9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GOLGA6CA6NDK9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms