Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POTEFA5A3E0 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POTEFA5A3E0 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms