Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
XIRP2A4UGR9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
XIRP2A4UGR9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
XIRP2A4UGR9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms