Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SNX9Q9Y5X1 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNX9Q9Y5X1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms