Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GTF3C3Q9Y5Q9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
GTF3C3Q9Y5Q9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms