Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E5

PCDHB4, Protocadherin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB4Q9Y5E5 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PCDHB4Q9Y5E5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PCDHB4Q9Y5E5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 218 ms