Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5A7

NUB1, NEDD8 ultimate buster 1, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUB1Q9Y5A7 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
NUB1Q9Y5A7 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NUB1Q9Y5A7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms