Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LRRC42Q9Y546 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRRC42Q9Y546 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms