Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B8

REXO2, Oligoribonuclease, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO2Q9Y3B8 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
REXO2Q9Y3B8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
REXO2Q9Y3B8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms