Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZDHHC9Q9Y397 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZDHHC9Q9Y397 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms