Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.51■■■□□ 2
COG6Q9Y2V7 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COG6Q9Y2V7 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COG6Q9Y2V7 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms