Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D1

ATF5, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF5Q9Y2D1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ATF5Q9Y2D1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATF5Q9Y2D1 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms