Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NOD1Q9Y239 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
NOD1Q9Y239 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms