Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQR0

SCML2, Sex comb on midleg-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML2Q9UQR0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCML2Q9UQR0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SCML2Q9UQR0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML2Q9UQR0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML2Q9UQR0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCML2Q9UQR0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms