Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ52

CNTN6, Contactin-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN6Q9UQ52 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CNTN6Q9UQ52 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CNTN6Q9UQ52 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms