Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
TRIM35Q9UPQ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TRIM35Q9UPQ4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms