Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULQ1

TPCN1, Two pore calcium channel protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPCN1Q9ULQ1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TPCN1Q9ULQ1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPCN1Q9ULQ1 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
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