Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MYH13Q9UKX3 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MYH13Q9UKX3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms