Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF3C4Q9UKN8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF3C4Q9UKN8 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms