Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY5

GGA1, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA1, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA1Q9UJY5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GGA1Q9UJY5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GGA1Q9UJY5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms