Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW3

DNMT3L, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3-like, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3LQ9UJW3 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DNMT3LQ9UJW3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DNMT3LQ9UJW3 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms