Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
MBD1Q9UIS9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MBD1Q9UIS9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms