Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP3

USP25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25Q9UHP3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
USP25Q9UHP3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP25Q9UHP3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms