Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO40Q9UH90 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms