Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRRDQ9UH36 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRRDQ9UH36 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms