Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NXF1Q9UBU9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NXF1Q9UBU9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms