Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT7

CTNNAL1, Alpha-catulin, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNAL1Q9UBT7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CTNNAL1Q9UBT7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CTNNAL1Q9UBT7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms