Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC9

SPRR3, Small proline-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRR3Q9UBC9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPRR3Q9UBC9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPRR3Q9UBC9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms