Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBC3

DNMT3B, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT3BQ9UBC3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
DNMT3BQ9UBC3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DNMT3BQ9UBC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms