Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGAP28Q9P2N2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGAP28Q9P2N2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms