Protein–RNA interactions for Protein: Q9P232

CNTN3, Contactin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN3Q9P232 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTN3Q9P232 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CNTN3Q9P232 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms