Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KCMF1Q9P0J7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KCMF1Q9P0J7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms