Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMOD2Q9NZR1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
TMOD2Q9NZR1 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD2Q9NZR1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD2Q9NZR1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD2Q9NZR1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
TMOD2Q9NZR1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
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