Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NKIRAS1Q9NYS0 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NKIRAS1Q9NYS0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms