Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CWC25Q9NXE8 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CWC25Q9NXE8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms