Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWB7

IFT57, Intraflagellar transport protein 57 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT57Q9NWB7 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
IFT57Q9NWB7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC28■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IFT57Q9NWB7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms