Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FANCLQ9NW38 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FANCLQ9NW38 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FANCLQ9NW38 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms