Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DNAJC17Q9NVM6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DNAJC17Q9NVM6 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms