Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC3

SLC38A7, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 7, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A7Q9NVC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
SLC38A7Q9NVC3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC38A7Q9NVC3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms