Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TMEM30AQ9NV96 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TMEM30AQ9NV96 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms