Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.61
PDS5BQ9NTI5 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
PDS5BQ9NTI5 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
PDS5BQ9NTI5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms