Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RRP7BPQ9NSQ0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC32.51■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
RRP7BPQ9NSQ0 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms