Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR19

ACSS2, Acetyl-coenzyme A synthetase, cytoplasmic, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSS2Q9NR19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ACSS2Q9NR19 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ACSS2Q9NR19 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms