Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQZ2

UTP3, Something about silencing protein 10, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP3Q9NQZ2 KANSL1-216ENST00000577114 629 ntTSL 510.57□□□□□ -0.727e-28■■■■■ 295
UTP3Q9NQZ2 KIAA0319L-212ENST00000473844 513 ntTSL 37.98□□□□□ -1.137e-28■■■■■ 295
UTP3Q9NQZ2 UTP6-207ENST00000579878 582 ntTSL 27.28□□□□□ -1.247e-28■■■■■ 295
UTP3Q9NQZ2 KIAA0319L-213ENST00000474856 295 ntTSL 36.77□□□□□ -1.337e-28■■■■■ 295
UTP3Q9NQZ2 LINC01572-206ENST00000624829 1666 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.463e-8■■■■■ 294.9
UTP3Q9NQZ2 ATXN2L-218ENST00000565971 3264 ntTSL 1 (best)15.77■□□□□ 0.121e-6■■■■■ 294.3
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-212ENST00000540530 1707 ntTSL 219.76■□□□□ 0.759e-7■■■■■ 294.1
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-220ENST00000622587 802 ntTSL 519.3■□□□□ 0.689e-7■■■■■ 294.1
UTP3Q9NQZ2 NDUFS7-206ENST00000535382 3050 ntTSL 215.42■□□□□ 0.069e-7■■■■■ 294.1
UTP3Q9NQZ2 PIGQ-210ENST00000476438 1775 ntTSL 220.45■□□□□ 0.865e-14■■■■■ 294.1
UTP3Q9NQZ2 TEX2-208ENST00000584379 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.455e-8■■■■■ 293.7
UTP3Q9NQZ2 TEX2-201ENST00000258991 5232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.465e-8■■■■■ 293.7
UTP3Q9NQZ2 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.324e-7■■■■■ 293.6
UTP3Q9NQZ2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.33e-39■■■■■ 293.5
UTP3Q9NQZ2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.933e-11■■■■■ 293.5
UTP3Q9NQZ2 CCT8-209ENST00000494296 514 ntTSL 313.3□□□□□ -0.283e-30■■■■■ 293.5
UTP3Q9NQZ2 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC7.79□□□□□ -1.162e-15■■■■■ 293.5
UTP3Q9NQZ2 BBX-207ENST00000416476 2178 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.083e-6■■■■■ 293.1
UTP3Q9NQZ2 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.363e-6■■■■■ 293.1
UTP3Q9NQZ2 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.413e-6■■■■■ 293.1
UTP3Q9NQZ2 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.533e-6■■■■■ 293.1
UTP3Q9NQZ2 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.976e-9■■■■■ 293.1
UTP3Q9NQZ2 DBN1-204ENST00000467054 793 ntTSL 215.17■□□□□ 0.026e-9■■■■■ 293.1
UTP3Q9NQZ2 TTC7B-203ENST00000553972 1719 ntTSL 1 (best)15.61■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 293.1
UTP3Q9NQZ2 TTC7B-205ENST00000554654 1847 ntTSL 313.81□□□□□ -0.25e-7■■■■■ 293.1
UTP3Q9NQZ2 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.251e-6■■■■■ 293.1
UTP3Q9NQZ2 PRKAA1-208ENST00000511248 668 ntTSL 210.63□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 292.9
UTP3Q9NQZ2 PRKAA1-203ENST00000397006 425 ntTSL 39.45□□□□□ -0.91e-7■■■■■ 292.9
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.25e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.185e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.055e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.745e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.545e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-212ENST00000532978 2489 ntTSL 218.35■□□□□ 0.535e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.495e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-205ENST00000392483 581 ntTSL 216.27■□□□□ 0.25e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.185e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 TPD52L1-215ENST00000534368 684 ntTSL 37.93□□□□□ -1.145e-7■■■■■ 292.8
UTP3Q9NQZ2 HERC1-208ENST00000560462 647 ntTSL 27.4□□□□□ -1.224e-7■■■■■ 292.3
UTP3Q9NQZ2 HERC1-203ENST00000558532 581 ntTSL 35.44□□□□□ -1.544e-7■■■■■ 292.3
UTP3Q9NQZ2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 292.2
UTP3Q9NQZ2 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.336e-7■■■■■ 292
UTP3Q9NQZ2 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.221e-10■■■■■ 291.9
UTP3Q9NQZ2 CAPRIN2-209ENST00000538387 882 ntTSL 35.68□□□□□ -1.57e-7■■■■■ 291.9
UTP3Q9NQZ2 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.36e-46■■■■■ 291.5
UTP3Q9NQZ2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.514e-7■■■■■ 290.9
UTP3Q9NQZ2 CHST12-203ENST00000432336 921 ntTSL 215.19■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 290.9
UTP3Q9NQZ2 RNA5SP207-201ENST00000390874 107 ntBASIC10.68□□□□□ -0.73e-9■■■■■ 290.9
UTP3Q9NQZ2 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.034e-7■■■■■ 290.9
UTP3Q9NQZ2 TTC7B-201ENST00000328459 19458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.963e-7■■■■■ 290.8
UTP3Q9NQZ2 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-8■■■■■ 290.7
UTP3Q9NQZ2 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.088e-7■■■■■ 290.3
UTP3Q9NQZ2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.552e-6■■■■■ 290.3
UTP3Q9NQZ2 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.612e-6■■■■■ 290.3
UTP3Q9NQZ2 CCDC57-218ENST00000583593 429 ntTSL 314.19□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 290
UTP3Q9NQZ2 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 289.6
UTP3Q9NQZ2 AKNA-203ENST00000312033 3334 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.093e-6■■■■■ 289.5
UTP3Q9NQZ2 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.992e-6■■■■■ 289.3
UTP3Q9NQZ2 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.98e-7■■■■■ 289.3
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.482e-10■■■■■ 288.9
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-215ENST00000521299 868 ntTSL 517.36■□□□□ 0.372e-10■■■■■ 288.9
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.242e-10■■■■■ 288.9
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-219ENST00000522663 2879 ntTSL 1 (best)13.65□□□□□ -0.222e-10■■■■■ 288.9
UTP3Q9NQZ2 MRNIP-216ENST00000521333 410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.42e-10■■■■■ 288.9
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF19-203ENST00000449495 921 ntTSL 221.28■■□□□ 14e-45■■■■■ 288.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.664e-45■■■■■ 288.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF19-204ENST00000471928 653 ntTSL 318.04■□□□□ 0.484e-45■■■■■ 288.8
UTP3Q9NQZ2 RABEP2-211ENST00000566762 545 ntTSL 416.77■□□□□ 0.289e-16■■■■■ 288.8
UTP3Q9NQZ2 ARHGEF19-205ENST00000478117 2035 ntTSL 1 (best)15.05■□□□□ 04e-45■■■■■ 288.8
UTP3Q9NQZ2 NRF1-202ENST00000311967 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-14■■■■■ 288.8
UTP3Q9NQZ2 NRF1-201ENST00000223190 2424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.211e-14■■■■■ 288.8
UTP3Q9NQZ2 NRF1-205ENST00000393232 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.411e-14■■■■■ 288.8
UTP3Q9NQZ2 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.445e-8■■■■■ 288.7
UTP3Q9NQZ2 CCDC142-203ENST00000454193 2309 ntTSL 220.94■□□□□ 0.944e-9■■■■■ 288.5
UTP3Q9NQZ2 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.014e-9■■■■■ 288.5
UTP3Q9NQZ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.07■■■□□ 2.084e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.94e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 NTAN1-208ENST00000568320 667 ntTSL 220.7■□□□□ 0.94e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.94e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.894e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.796e-7■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.669e-25■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.236e-7■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.26e-7■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.166e-7■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 SLC26A11-209ENST00000571888 537 ntTSL 415.24■□□□□ 0.036e-7■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 NTAN1-203ENST00000565187 1043 ntTSL 211.71□□□□□ -0.534e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 NTAN1-202ENST00000563940 354 ntTSL 510.5□□□□□ -0.734e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-214ENST00000487282 777 ntTSL 29.69□□□□□ -0.864e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 NTAN1-204ENST00000566419 738 ntTSL 39.51□□□□□ -0.894e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 LRCH3-219ENST00000494069 783 ntTSL 59.12□□□□□ -0.959e-25■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 DLST-211ENST00000555988 718 ntTSL 58.88□□□□□ -0.994e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 NTAN1-209ENST00000568738 439 ntTSL 27.95□□□□□ -1.144e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-207ENST00000414288 556 ntTSL 47.94□□□□□ -1.144e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-209ENST00000441005 1455 ntTSL 36.66□□□□□ -1.344e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-211ENST00000464964 699 ntTSL 56.4□□□□□ -1.384e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-206ENST00000413938 1940 ntTSL 1 (best)6.01□□□□□ -1.454e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.644e-19■■■■■ 288.4
UTP3Q9NQZ2 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.482e-7■■■■■ 288.4
Retrieved 100 of 52,753 protein–RNA pairs in 415.5 ms