Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU9

BRMS1, Breast cancer metastasis-suppressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1Q9HCU9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BRMS1Q9HCU9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRMS1Q9HCU9 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms