Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
APOBEC3GQ9HC16 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
APOBEC3GQ9HC16 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
APOBEC3GQ9HC16 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms