Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
USP29Q9HBJ7 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
USP29Q9HBJ7 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms