Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM12Q9H4Q4 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRDM12Q9H4Q4 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRDM12Q9H4Q4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms